Kajian mengenal pasti bakteria yang dikaitkan dengan kelahiran pramatang

Penyelidik di North Carolina State University telah mendapati bahawa pelbagai spesies Gardnerella, bakteria yang kadangkala dikaitkan dengan bakteria vaginosis (BV) dan kelahiran pramatang, boleh wujud bersama dalam mikrobiom faraj yang sama. Penemuan yang diterbitkan dalam jurnal mSystems, menambah pemahaman yang semakin meningkat tentang kesan Gardnerella terhadap kesihatan manusia.

Gardnerella ialah sekumpulan bakteria anaerobik yang biasa terdapat dalam mikrobiom faraj. Tahap tinggi bakteria ini adalah ciri BV dan dikaitkan dengan peningkatan risiko kelahiran pramatang, tetapi ia juga ditemui pada wanita tanpa bukti penyakit itu.

"Kami cuba memahami kepelbagaian dalam Gardnerella, " kata Ben Callahan, profesor bersekutu kesihatan penduduk dan patobiologi di North Carolina State University dan pengarang bersama kertas itu.

"Para saintis baru-baru ini mula mengkaji spesies individu Gardnerella, jadi kami belum tahu sama ada spesies yang berbeza mungkin mempunyai kesan kesihatan yang berbeza. Matlamat utama kami adalah untuk mengkaji ekologi Gardnerella."

Cabaran unik penjujukan mikrobiom faraj ialah mana-mana sampel terutamanya terdiri daripada DNA perumah, menjadikan pengekstrakan data mikrob lebih mahal dan intensif buruh. Tugas pertama pasukan penyelidik adalah untuk membangunkan metodologi yang membolehkan pengenalpastian spesies Gardnerella yang berbeza daripada data mikrobiom.

"Alat yang tersedia untuk mengkaji mikrobiom faraj merawat semua Gardnerella sebagai satu spesies, " kata Hannah Berman, rakan pasca doktoral di North Carolina State University dan pengarang utama kertas itu. "Untuk melakukan kerja ini, kami perlu membina pangkalan data genom Gardnerella kami sendiri dan membangunkan kaedah untuk mengenal pasti spesies Gardnerella yang berbeza. Mudah-mudahan, ini juga akan membolehkan lebih ramai penyelidik mengkaji kepelbagaian Gardnerella."

Pasukan penyelidik meneliti data penjujukan daripada tiga kohort: dua populasi rawak wanita hamil dan satu populasi dengan sejarah kelahiran pramatang. Mereka menganalisis jujukan metagenomik Gardnerella daripada sampel untuk melihat sama ada terdapat kaitan antara spesies Gardnerella tertentu dan kelahiran pramatang.

Walaupun mereka tidak menjumpai "pistol merokok," mereka telah membuat dua penemuan yang mengejutkan.

Pertama, mereka mengenal pasti spesies ke-14 Gardnerella yang berpotensi di kalangan sampel-sebelum kerja ini, hanya 13 spesies telah dikenal pasti.

Mereka juga mendapati bahawa dalam kebanyakan sampel yang mengandungi Gardnerella, beberapa spesies Gardnerella wujud bersama dalam mikrobiom yang sama: antara dua dan kesemua 14 spesies Gardnerella yang diketahui ditemui dalam sampel individu.

"Biasanya, jika spesies bakteria menjajah persekitaran, kami mengharapkan ia mengecualikan saudara terdekat yang menduduki niche ekologi yang sama dan menggunakan sumber yang sama, " kata Callahan. "Saya sering mengatakan bahawa dengan bakteria, segala-galanya mungkin, tetapi ini masih luar biasa. Kami juga melihat bahawa apabila beban mikrob keseluruhan lebih tinggi, Gardnerella membentuk bahagian yang lebih besar daripada beban itu.

"Bukti terus terkumpul bahawa Gardnerella dikaitkan dengan kelahiran pramatang, tetapi butiran hubungan ini adalah rumit. Dalam kerja ini, kami tidak menemui satu spesies Gardnerella yang berbahaya - mungkin semuanya berbahaya. Ini jauh dari penghujung cerita."

Para penyelidik berharap untuk mengkaji lebih lanjut isu kewujudan bersama spesies dan komposisi mikrobiom.

"Mikrobiom faraj kurang dihargai, " kata Callahan. "Sebagai contoh, ia sering dikuasai oleh satu spesies Lactobacillus, yang mewujudkan persekitaran yang mengecualikan bakteria lain. Apabila itu hilang, Gardnerella ada di sana. Jadi bagaimana bakteria ini berinteraksi?

"Jawapan kepada soalan ini boleh membawa kepada rawatan yang lebih berkesan untuk BV dan cara untuk meramal dan mencegah kelahiran pramatang. Kerja ini merupakan langkah penting dalam proses itu."