Semua probiotik terbahagi kepada beberapa kumpulan, bergantung kepada asas klasifikasi. Komposisi probiotik mungkin termasuk beberapa komponen, dalam kaitan ini, persediaan monokomponen diasingkan yang hanya mempunyai satu jenis bakteria tertentu. Mikroorganisma ini tidak semestinya berguna untuk usus, khususnya untuk mikroflora.