Penentuan antibodi kepada pecahan microsomal kelenjar tiroid digunakan untuk mendiagnosis tiroiditis autoimun dan hipotiroidisme, di mana tahap antibodi dalam darah meningkat. Antibodi untuk mikrosom tiroid membentuk kompleks imun pada permukaan sel, mengaktifkan pelengkap dan limfosit sitotoksik, yang membawa kepada pemusnahan sel dan pembentukan proses keradangan dalam kelenjar tiroid.