HCV genom mengandungi RNA bebenang tunggal yang bercas positif, yang mengkod 3 struktur (protein teras nucleocapsid dan nucleoproteins E1-E2 sampul surat) dan 5 struktur protein (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5). Untuk setiap protein ini disintesis AT, yang terdapat dalam darah pesakit dengan hepatitis C. Virus