Sesetengah jenis hepatitis autoimun tidak mempunyai punca yang dikenal pasti dengan jelas, manakala yang lain dikaitkan dengan agen yang diketahui seperti asid thienic (diuretik) atau dengan penyakit seperti hepatitis C dan D. Secara amnya, hepatitis autoimun yang etiologi tidak diketahui mempunyai gambaran klinikal yang lebih dramatik, dengan aktiviti transaminase serum yang lebih tinggi dan paras γ-globulin, histologi hati yang menunjukkan tindak balas yang lebih baik daripada kes kortikosteroid.