Anomali struktur parenkim buah pinggang dibahagikan kepada megacalyx, penyakit Fanconi, dan buah pinggang spongy. Kecacatan perkembangan ini selalunya disertai dengan fungsi buah pinggang terjejas.
Gabungan buah pinggang adalah kecacatan perkembangan yang menunjukkan dirinya dalam gabungan dua buah pinggang menjadi satu organ. Anomali ini berlaku dengan kekerapan 3.5% kes di kalangan semua kecacatan buah pinggang.
Dystopia renal adalah anomali perkembangan yang dicirikan oleh kedudukan abnormal struktur buah pinggang. Kecacatan perkembangan ini berlaku dengan kekerapan 2.8% daripada semua kecacatan perkembangan buah pinggang.
Hipoplasia buah pinggang adalah anomali perkembangan yang dicirikan oleh pengurangan saiz buah pinggang. Kecacatan ini berlaku dengan kekerapan 0.9% di antara semua anomali buah pinggang.
Duplikasi buah pinggang adalah kecacatan buah pinggang yang paling biasa, menyumbang 10.4% daripada semua anomali saluran kencing. Menurut penemuan patologi, duplikasi buah pinggang berlaku pada kekerapan 1:150.
Agenesis, atau aplasia buah pinggang - buah pinggang tunggal kongenital, ketiadaan lengkap buah pinggang dan saluran buah pinggang menyumbang 1% daripada semua kecacatan. Kekerapan anomali, menurut data bedah siasat, adalah 1 dalam 1100.
Anomali vaskular buah pinggang dibahagikan kepada kecacatan kongenital struktur, kuantiti, bentuk dan lokasi saluran arteri dan kerap didiagnosis di kalangan semua anomali buah pinggang dan saluran kencing.
Chyluria adalah keadaan patologi yang disertai dengan pembebasan limfa dengan air kencing. Air kencing berwarna susu. Chyluria berlaku akibat fistula antara sistem limfa dan saluran kencing.
Bacteriuria adalah keadaan patologi yang dicirikan oleh kehadiran bakteria dalam air kencing. Bacteriuria adalah tanda proses keradangan di buah pinggang dan saluran kencing.