Kekurangan enterokinase kongenital dijelaskan, serta ketidakcukupan enzim sementara pada bayi yang terlalu awal. Oleh kerana kekurangan enterokinase, terjemahan trypsinogen ke trypsin terganggu, hasilnya - pemisahan protein dalam usus kecil. Dengan patologi duodenal, kekurangan duodenase, yang membawa kepada kekurangan peptidase, juga mungkin.